根据党的十八届三中全会提出的“坚定不移地实施主体功能区制度，建立国土空间开发保护制度”的精神、《国务院关于加强环境保护重点工作的意见》（国发﹝2011﹞35号）开展环境功能区划的要求、以及《贯彻实施国家主体功能区环境政策的若干意见》（环发﹝2015﹞92号）环境功能区划分的总体要求和标准，以科学发展观为指导，加快实施主体功能区战略，按照人口资源环境相均衡、经济社会生态效益相统一的原则，对东莞市区进行环境功能区划分，并建立“分区管理、分类指导”的环境管理体系。
《广东省人民政府关于印发广东省主体功能区规划的通知》（粤府﹝2015﹞120号）关于区域主体功能区划的定位、《中共东莞市委关于全面深化改革的实施意见》（东委发﹝2014﹞1号）“全面加强和细化环境功能区划管理，有效调控城市建设与环境保护”的要求，从省层面和市层面上明确区域空间管控理念，以优化东莞市区国土空间开发格局，保障环境、社会、经济的可持续发展。
根据东莞市国土环境结构、环境状态和使用功能上的分异规律，结合社会经济发展现状和未来趋势，科学分析、准确界定各区域的主导环境功能，把国土空间依次划分为自然生态红线区、重要生态功能区、农产品环境保障区、人居环境保障区、环境优化准入区以及环境重点准入区。通过分区制定环境管理要求和措施，促进自然资源有序开发和产业合理布局，促进形成人口、经济、资源环境相协调的国土空间格局。
1、科学评估，尊重自然
根据东莞市自然环境基本特征和空间分布规律，综合评价环境承载能力、环境功能和经济社会发展状态，结合发展趋势的预测，以及人类生存、生活、生产、发展对环境功能不同需求的评估，科学确定环境功能。
2、统筹协调，科学引导
统筹考虑与主体功能区规划、水功能区划、生态功能区划等相关专项规划、区划的衔接，协调生态、水环境、大气环境、土壤等环境要素之间的相互关系，与相关部门已有管理模式衔接，明确不同环境功能区的环境目标，优化各类环境功能布局。
3、突出主导，优化格局
以突出体现分区主导环境功能为主，兼顾分区多重环境功能，制定有利于保护与提升主导环境功能的环境管理目标和对策，保障环境安全，从大局出发，优化保障生态安全和人群生活生产健康的空间格局。
4、全面整合，重点控制
依照国家环境功能区划分类体系要求，全面、综合考虑环境功能区划各环境要素以及资源开发与发展需要，从全局出发，最大程度地将环境敏感要素与资源开发、工业发展等特殊区域与环境功能分区结合起来，明确环境敏感区和发展规划目标区与环境功能区的关系。
5、调控保护，引导发展
在科学评估环境功能的基础上，充分结合主体功能区规划及经济发展地域的要求，遵循在发展中保护，在保护中发展，坚持“面上保护、点上开发”的原则，统筹协调地区功能定位和发展方向，综合考虑发展与保护的关系。
1.《国务院关于加强环境保护重点工作的意见》（国发〔2011〕35号）；
2.《全国环境功能区划纲要》（2012）；
3.《环境功能区编制技术指南》（2013）；
4.《贯彻实施国家主体功能区环境政策的若干意见》（环发〔2015〕92号）；
5.《国务院关于印发水污染防治行动计划的通知》（国发〔2015〕17号）；
6.《国务院关于印发大气污染防治行动计划的通知》（国发〔2013〕37号）；
7.《国务院关于印发土壤污染防治行动计划的通知》（国发〔2016〕31号）；
8.《广东省土地利用总体规划条例》（2009）；
9.《广东省人民政府关于印发广东省主体功能区规划的通知》（粤府〔2012〕120号）；
10.《广东省近岸海域环境功能区划》（粤府办〔1999〕68号）；
11.《广东省地表水环境功能区划》（粤环〔2011〕14号）；
12.《东莞市国民经济和社会发展第十三个五年规划纲要》的通知（东府〔2016〕38号）；
13.《东莞市土地利用总体规划（2006~2020）》（2009）
14.《东莞市城市总体规划（2016~2030））》纲要（2015）；
15.《东莞市环境保护和生态建设“十二五”规划》（东府办〔2011〕110号）；
16.《东莞市环境保护规划纲要（2006~2020）》（东府〔2009〕137号）；
17.《东莞市农业农村发展“十二五”规划》（东府〔2012〕41号）；
18.《东莞水乡特色发展经济区生态环境规划（2015~2030）》（东环〔2015〕173号）；
19.《东莞水乡特色发展经济区旅游发展规划（2015~2030）》；
20.《东莞市生态林业发展“十二五”规划》（东府办〔2011〕119号）；
21.《广东麻涌华阳湖国家湿地公园总体规划（2016-2020）》；
22.《东莞旅游城市建设发展规划》（2015-2020）；
23.《东莞市低碳发展“十三五”规划》；
24.《东莞市海洋功能区划（2013-2020年）》；
25.东莞市林业局各自然保护区、森林公园、湿地公园规划。
区划范围为行政区域所辖陆地范围，包括东莞市全部的陆域和水域，有33个镇街（园区），总计陆地面积2460平方公里。
若由于社会经济发展的动态性，以及生态文明发展的需求，环境功能区的边界、环境目标也会随着发生动态变化，因此，环境功能区划需要动态调整机制。乡镇根据需求制定功能区调整方案，由市环保部门组织进行科学论证，论证通过后，报原审批机关进行批准。
环境功能区调整应提供调整科学论证报告、矢量数据、图件、登记表等材料，并备案。
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